Станция Бежецк была сдана в эксплуатацию в 1870 г. В станционный комплекс входила одна платформа, здание вокзала 1871 г. постройки, паровозный сарай, мастерские, водонапорная башня, нефтекачка, водокачка, баня, товарная контора, западная и восточная будки стрелочника, детсмкий сад, два жилых дома.

В здании вокзала был вестибюль, три зала ожидания, багажное отделение, кассы, кабинет начальника станции, жилое помещение.

Во время Великой Отечественной войны немецкая авиация неоднократно бомбила станцию, самым разрушительным был налет 29.10.1941 г.

В октябре 2005 г. Октябрьская железная дорога и администрация города в здании вокзала установили мемориальную доску в память о погибших при бомбардировке.

В 1991 г. по проекту архитектора В.И.Кузнецова построено новое здание вокзала, обновлен перрон.