Станция Волочаевка-1 введена в эксплуатацию в составе бывшей Восточно-Амурской железной дороги в 1915 году. Станция названа по близлежащему селу Волочаево, основанному в 1908 году крестьянами-переселенцами из станицы Ивановской Кубанской области и названному в по фамилии старосты нового поселения Волочаева (Волочая) Макара Семеновича (1848 – 1926).
В 2020 – 2021 годах, в преддверии 100-летнего юбилея Волочаевского сражения в годы Гражданской войны, в соответствии с государственной программой «Культура России» были проведены реставрационные работы по восстановлению мемориала «Памятник-музей, сооруженный в честь Волочаевских боев».
В здании современного вокзала оформлен мемориальный зал с мозаичными панно и бюстами на тему Гражданской войны. Здание железнодорожного вокзала построено в 1973 году.
