Первый железнодорожный вокзал станции Яр был открыт в 1897 году.
В 1947 году в Яру на смену ветхому зданию вокзала было построено новое, благоустроенное. Но, спроектированное из расчета на 200 пассажиров, оно сразу же вместо «удобств» принесло пассажирам одни разочарования. Дело в том, что, проектируя вокзал, ни заказчик – отделение движения, ни проектировщики не учли увеличение пассажиропотока, вызванное ростом промышленности в Удмуртии и районах Предуралья. В результате Ярский вокзал ежесуточно обслуживал до 1200 пассажиров вместо запланированных 200.
В 2007 году были начаты работы по капитальному ремонту здания вокзала на станции Яр. В 2009 году открыл свои двери обновленный вокзал.