Железнодорожная станции Хотьково была открыта 18 августа 1862 года, одновременно с запуском всей ветки Троице-Сергиевской железной дороги.

Изначально станция называлась «Хотьковская» и как тогда говорили размещалась в 55 верстах от Москвы. Поезда ходили нечасто. Тем не менее, уже к 1863 году железная дорога перевезла 417736 пассажиров.

После революции, в 1933 году станция была электрифицирована. А вот во время Великой Отечественной войны с 1941 по 1942 годы станцию пришлось временно демонтировать.