Название станция получила от озера, расположенного рядом, в Чановском районе. С тюркского «кара» – «черный», «чи» – «ил». Соответственно «карачи» переводится как «черный ил» или «черная грязь».
В августе 2007 года накануне празднования Дня железнодорожника на станции Озеро-Карачинское открыт новый железнодорожный вокзал с благоустроенной прилегающей территорией. Объект реконструирован при долевом участии ОАО «РЖД» и администрации Новосибирской области.
Вокзал — визитная карточка Чановского района, «золотой ключик» к курорту «Озеро Карачи».